Die Durchschnittskosten einer Webkonferenz betragen bei einem angenommenen Volumen von 50 Meetings im Jahr á 4 Teilnehmer zwischen 9 und 70 Euro. Dazu kommen bei 12 Cent/Min. jeweils 28,80 Euro an Telefonkosten. Zwar wird auch bereits die kostengünstigere Audio-Übermittlung per Voice over IP angeboten, sie ist jedoch qualitativ - vor allem bei Vollduplex (spontane Redemöglichkeit) noch nicht ausgereift.

Großkunden und Konferenzkunden, die Wert auf Vertraulichkeit legen müssen oder die größtenteils im Intranet kommunizieren möchten, können bei einigen Anbietern eigene Server-Lizenzen kaufen, wobei die Lizenzkosten zwischen 4.000 und 20.000 Euro liegen können.

Die Verbindungs- und Übertragungskosten können bei der heutzutage üblichen Flatrate vernachlässigt werden.